नए सॉफ्टवेयर की भविष्यवाणी की सेल भाग्य — ScienceDaily


पारंपरिक एकल कोशिका के अनुक्रमण तरीकों में मदद करने के लिए प्रकट के बारे में अंतर्दृष्टि सेलुलर मतभेद और कार्यों के साथ-लेकिन वे ऐसा स्थैतिक के साथ फोटो ही नहीं बल्कि की तुलना में समय चूक फिल्मों. इस सीमा के बनाता है यह मुश्किल के लिए के बारे में निष्कर्ष आकर्षित गतिशीलता सेल के विकास और जीन गतिविधि. हाल ही में शुरू की विधि “शाही सेना वेग” के लिए करना है, के पुनर्निर्माण के विकास की गति एक सेल पर एक कम्प्यूटेशनल आधार (लाभ अनुपात के unspliced और spliced टेप). इस विधि, तथापि, के लिए लागू होता है स्थिर राज्य की आबादी ही है । शोधकर्ताओं थे, इसलिए तरीके के लिए देख करने के लिए विस्तार की अवधारणा शाही सेना वेग के लिए गतिशील आबादी जो कर रहे हैं के लिए महत्वपूर्ण महत्व को समझने के लिए सेल के विकास और रोग की प्रतिक्रिया है ।

एकल सेल वेग

शोधकर्ताओं के संस्थान से कम्प्यूटेशनल जीव विज्ञान में Helmholtz Zentrum München और विभाग के गणित में TUM विकसित “scVelo” (एकल सेल वेग). विधि अनुमान शाही सेना वेग के साथ एक एअर इंडिया-आधारित मॉडल को सुलझाने के द्वारा पूरा जीन-बुद्धिमान ट्रांसक्रिप्शनल गतिशीलता. यह उन्हें अनुमति देता है के लिए सामान्य अवधारणा के शाही सेना वेग की एक विस्तृत विविधता के जैविक प्रणालियों सहित गतिशील आबादी.

“हम इस्तेमाल किया है scVelo प्रकट करने के लिए सेल के विकास में अंत: स्रावी अग्न्याशय में, हिप्पोकैम्पस, और अध्ययन करने के लिए गतिशील प्रक्रियाओं में फेफड़ों के उत्थान-और यह सिर्फ शुरुआत है,” कहते हैं वोल्कर बर्गन, मुख्य निर्माता के scVelo और पहले लेखक के इसी अध्ययन में प्रकृति जैव प्रौद्योगिकी.

के साथ scVelo शोधकर्ताओं का अनुमान कर सकते हैं प्रतिक्रिया की दर आरएनए प्रतिलेखन splicing और गिरावट की आवश्यकता के बिना किसी भी प्रयोगात्मक डेटा. इन दरों की मदद कर सकते हैं बेहतर समझने के लिए सेल पहचान और प्ररूपी विविधता. उनके परिचय का एक अव्यक्त समय reconstructs अज्ञात विकास के लिए समय की स्थिति के साथ कोशिकाओं की गति अंतर्निहित जैविक प्रक्रिया है । है कि विशेष रूप से उपयोगी है बेहतर समझने के लिए सेलुलर निर्णय लेने. इसके अलावा, scVelo पता चलता विनियामक परिवर्तन और ख्यात ड्राइवर जीन उसमें । इस में मदद करता है समझने के लिए कैसे न केवल, लेकिन यह भी क्यों कोशिकाओं को विकसित कर रहे हैं जिस तरह से वे करते हैं.

सशक्त व्यक्तिगत उपचार

ऐ-आधारित उपकरणों की तरह scVelo जन्म दे करने के लिए व्यक्तिगत उपचार. जा रहा से स्थिर स्नैपशॉट करने के लिए पूर्ण गतिशीलता की अनुमति देता है, शोधकर्ताओं से स्थानांतरित करने के लिए वर्णनात्मक की दिशा में भविष्य कहनेवाला मॉडल. भविष्य में, यह मदद कर सकता है बेहतर समझने के लिए रोग प्रगति के रूप में इस तरह के ट्यूमर के गठन, या जानने के लिए सेल संकेतन में प्रतिक्रिया करने के लिए कैंसर के उपचार के लिए ।

“scVelo डाउनलोड किया गया है लगभग 60,000 बार अपनी रिहाई के बाद से पिछले साल. यह एक कदम पत्थर बन गया tooltowards गतिज नींव के लिए एकल कोशिका transcriptomics,” कहते हैं प्रो. अवसर की प्रतीक्षा करनेवाला थीस, की कल्पना की है जो अध्ययन और कार्य करता है के रूप में संस्थान में निदेशक के लिए कम्प्यूटेशनल जीव विज्ञान में Helmholtz Zentrums München और कुर्सी के लिए गणितीय मॉडलिंग के जैविक प्रणालियों में TUM.

कहानी का स्रोत:

सामग्री द्वारा ही प्रदान की जाती Helmholtz Zentrum München – जर्मन अनुसंधान केन्द्र के लिए पर्यावरणीय स्वास्थ्य. नोट: सामग्री संपादित किया जा सकता है के लिए शैली और लंबाई ।



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