PolyA-खान में काम करनेवाला का आकलन प्रभाव के वैकल्पिक polyadenylation पर जीन अभिव्यक्ति — ScienceDaily


शोधकर्ताओं में एक ब्याज के साथ unraveling जीन विनियमन में मानव स्वास्थ्य और रोग हैं, अपने क्षितिज का विस्तार के द्वारा बारीकी से देख वैकल्पिक polyadenylation (ए पी ए), एक के तहत सनदी तंत्र को नियंत्रित करता है कि जीन की अभिव्यक्ति.

“आपा के बारे में एक को संशोधित करने के समाप्त होता है कहा जाता है, 3-प्रधानमंत्री अंत (3’end), शाही सेना की किस्में हैं कि लिखित से डीएनए. संशोधन के होते हैं, लंबाई को बदलने के लिए एक पूंछ के adenosines, एक आरएनए इमारत ब्लॉकों पर, 3’end से पहले, आरएनए अनुवाद किया है, प्रोटीन में कहा,” पहले लेखक डॉ हरि कृष्ण Yalamanchili, एक postdoctoral सहयोगी में लैब के डॉ Zhandong लियू पर Baylor कॉलेज ऑफ मेडिसिन के. “इस एडेनोसाइन श्रृंखला में मदद करता है निर्धारित करने के लिए कैसे लंबे समय के मैसेंजर आरएनए में रहता है सेल, को प्रभावित कितना प्रोटीन का उत्पादन किया है से इसे.”

ब्याज में ए पी ए में हुई है विकास के कई 3′ अनुक्रमण (3’Seq) तकनीक है कि अनुमति देने के लिए सटीक पहचान पर APA साइटों पर आरएनए किस्में. लेकिन क्या शोधकर्ताओं याद कर रहे हैं, एक मजबूत कम्प्यूटेशनल उपकरण है कि विशेष रूप से डिजाइन का विश्लेषण करने के लिए धन की 3’Seq किया गया है कि डेटा उत्पन्न होता है ।

मिलने PolyA-खान में काम करनेवाला

“अब तक, शोधकर्ताओं का उपयोग किया गया है पारंपरिक शाही सेना अनुक्रमण कम्प्यूटेशनल उपकरण का विश्लेषण करने के लिए 3’Seq डेटासेट. हालांकि इस दृष्टिकोण के परिणाम का उत्पादन नहीं करता है, की क्षमता को अधिकतम है कि जानकारी की राशि से निकाला जा सकता है कि डेटा,” Yalamanchili कहा. “यहाँ हम एक विकसित कम्प्यूटेशनल उपकरण है कि ठीक से विश्लेषण 3’Seq डेटा. हम यह कहते हैं PolyA खान में काम करनेवाला है.”

Yalamanchili और उनके सहयोगियों ने इस्तेमाल किया अपने नए कम्प्यूटेशनल उपकरण का विश्लेषण करने के लिए मौजूदा 3’Seq डेटासेट. PolyA-खान में काम करनेवाला न केवल reproduced विश्लेषण के साथ हासिल की पारंपरिक कम्प्यूटेशनल उपकरण, लेकिन यह भी पहचान की उपन्यास ए पी ए साइटों है कि नहीं पता चला रहे थे के साथ अन्य विश्लेषणात्मक दृष्टिकोण है.

“हम हैरान थे जब PolyA-खान में काम करनेवाला के विश्लेषण के एक ग्लियोब्लास्टोमा सेल लाइन डेटासेट की पहचान की दो बार से अधिक संख्या के जीन के साथ ए पी ए में परिवर्तन की तुलना में शुरू में थे की सूचना दी,” Yalamanchili कहा.

“मुझे लगता है कि सबसे रोमांचक भाग के इस नए उपकरण है कि यह करने के लिए सक्षम बनाता ठीक प्रतिबिंबित जीन-स्तर 3′ में परिवर्तन और की पहचान करने के लिए कई ए पी ए की घटनाओं से पहले की तुलना में. के साथ अन्य विश्लेषणात्मक दृष्टिकोण, हम बहुत मूल्यवान समझना के प्रभाव और संख्या की पाली adenylation घटनाओं,” ने कहा लियू, एसोसिएट प्रोफेसर के बाल रोग और न्यूरोलॉजी में Baylor और जनवरी और दान डंकन तंत्रिका विज्ञान अनुसंधान संस्थान में टेक्सास बच्चों के अस्पताल.

तत्काल अनुप्रयोगों

इस विकास के जबरदस्त प्रभाव के लिए बुनियादी अनुसंधान के लिए और संभावित अनुवाद के वैज्ञानिक निष्कर्षों के क्लिनिक में. ए पी ए में माना जाता है एक प्रमुख तंत्र के लिए शाही सेना विनियमन है कि मजबूत प्रासंगिकता दोनों में कैंसर और मस्तिष्क संबंधी बीमारियों । PolyA-खान में काम करनेवाला कर सकते हैं वैज्ञानिकों की सहायता की तलाश की पहचान करने के लिए आनुवंशिक इन रोगों के कारणों का निर्धारण करने के द्वारा कि क्या वहाँ मतभेद रहे हैं में ए पी ए के बीच रोगग्रस्त और सामान्य कोशिकाओं. के साथ इस नए विश्लेषण, वैज्ञानिकों के एक ताजा देखो ले लो पर मौजूदा जीनोमिक डेटासेट हो सकता है कि एक जवाब प्रदान करने के लिए कारण मानव की स्थिति, के रूप में अच्छी तरह के रूप में अध्ययन नव विकसित डेटासेट.

“इससे पहले, लोगों को पता था के बारे में ए पी ए में परिवर्तन, लेकिन नहीं था, उन पर विचार किया जा करने के लिए प्रमुख योगदान करने के लिए जीन विनियमन मुख्य रूप से, क्योंकि हम का अभाव कम्प्यूटेशनल उपकरण निर्धारित करने के लिए ए पी ए के समग्र प्रभाव पर जीन की अभिव्यक्ति,” Yalamanchili कहा. “PolyA-खान में दिखाया गया है कि ए पी ए के लिए लगता है, एक बड़ी भूमिका निभाने में जीन विनियमन की तुलना में हम पहले सोचा था.”

कहानी का स्रोत:

सामग्री द्वारा ही प्रदान की जाती Baylor कॉलेज ऑफ मेडिसिन. मूल द्वारा लिखित Ana María Rodríguez, पीएच. डी. नोट: सामग्री संपादित किया जा सकता है के लिए शैली और लंबाई ।



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