अद्वितीय सूची के मानव आंत पारिस्थितिकी तंत्र — ScienceDaily


वैज्ञानिकों की एक अंतरराष्ट्रीय टीम है collated सभी ज्ञात बैक्टीरियल जीनोम से मानव आंत microbiome में एक बड़ी डेटाबेस है । उनके काम में प्रकाशित प्रकृति जैव प्रौद्योगिकीकी अनुमति देगा , शोधकर्ताओं का पता लगाने के लिए लिंक्स के बीच बैक्टीरियल जीन और प्रोटीन, और उनके मानव स्वास्थ्य पर प्रभाव.

इस परियोजना के नेतृत्व में किया गया था EMBL के यूरोपीय जैव सूचना विज्ञान संस्थान (EMBL-EBI) और शामिल सहयोगियों से वेलकम Sanger संस्थान, विश्वविद्यालय के ट्रेंटो में, ग्लैडस्टोन संस्थान, और अमेरिका के ऊर्जा विभाग के संयुक्त जीनोम संस्थान है.

अधिक रोगाणुओं से मानव कोशिकाओं की तुलना

बैक्टीरिया कोट, मानव शरीर के अंदर और बाहर. वे प्रोटीन का उत्पादन है कि हमारी पाचन क्रिया को प्रभावित, हमारे स्वास्थ्य और हमारी संवेदनशीलता रोगों के लिए. वे कर रहे हैं बहुत प्रचलित है कि शरीर में अनुमान लगाया गया है शामिल करने के लिए और अधिक कोशिकाओं में इसकी microbiome — बैक्टीरिया, कवक और अन्य रोगाणुओं की तुलना में यह मानव कोशिकाओं.

भूमिका को समझने के लिए है कि बैक्टीरियल प्रजातियों में खेलने मानव जीव विज्ञान, वैज्ञानिकों आम तौर पर अलग-थलग और संस्कृति उन्हें प्रयोगशाला में इससे पहले कि वे उनके डीएनए अनुक्रम. हालांकि, कई जीवाणु पलते में स्थिति कर रहे हैं कि नहीं अभी तक प्रतिलिपि प्रस्तुत करने योग्य में एक प्रयोगशाला की स्थापना ।

जानकारी प्राप्त करने के लिए इस तरह की प्रजातियों में, शोधकर्ता एक और दृष्टिकोण: वे इकट्ठा एक एकल नमूना पर्यावरण से-इस मामले में, मानव आंत-और अनुक्रम डीएनए से पूरे नमूना है । वे तो उपयोग कम्प्यूटेशनल तरीकों के लिए फिर से संगठित व्यक्ति के जीनोम के हजारों प्रजातियों में से है कि एक नमूना है. इस विधि कहा जाता है, metagenomics, प्रदान करता है एक शक्तिशाली वैकल्पिक करने के लिए अलग और अनुक्रमण डीएनए की अलग-अलग प्रजातियां हैं ।

जैव विविधता मानव आंत में

“पिछले साल, तीन स्वतंत्र टीमों, हमारा सहित, खंगाला के हजारों आंत microbiome जीनोम. बड़ा सवाल थे कि क्या इन टीमों था तुलनीय परिणाम है, और है कि क्या हम कर सकते पूल में उन्हें एक व्यापक सूची कहते हैं,” रोब फिन, टीम के नेता पर EMBL-EBI.

वैज्ञानिकों ने अब संकलित 200,000 जीनोम और 170 मिलियन प्रोटीन दृश्यों से अधिक से अधिक 4 600 बैक्टीरियल प्रजातियों में मानव आंत. अपने नए डेटाबेस, एकीकृत मानव जठरांत्र जीनोम संग्रह और एकीकृत जठरांत्र प्रोटीन सूची से पता चलता है, जबरदस्त विविधता में हमारी हिम्मत और के लिए मार्ग प्रशस्त आगे microbiome अनुसंधान.

“इस विशाल सूची में एक मील का पत्थर microbiome अनुसंधान, और हो जाएगा एक अमूल्य संसाधन के लिए वैज्ञानिकों ने अध्ययन शुरू करने के लिए और उम्मीद है कि भूमिका को समझने के प्रत्येक बैक्टीरियल प्रजातियों में मानव आंत पारिस्थितिकी तंत्र बताते हैं,” निकोला Segata, प्रधान अन्वेषक के विश्वविद्यालय में ट्रेंटो.

परियोजना से पता चला है कि 70% से अधिक का पता लगाया बैक्टीरियल प्रजातियों में कभी नहीं गया था सुसंस्कृत प्रयोगशाला में-उनके शरीर में गतिविधि अनजान बनी हुई है. सबसे बड़ा समूह है कि बैक्टीरिया की कि श्रेणी में गिर जाता है Comantemales, एक आदेश के पेट के बैक्टीरिया में पहले वर्णित 2019 में एक अध्ययन के नेतृत्व में बोर्क समूह में EMBL हीडलबर्ग.

“यह एक असली आश्चर्य था देखने के लिए कैसे व्यापक Comantemales कर रहे हैं. इस पर प्रकाश डाला गया कैसे थोड़ा हम के बारे में पता बैक्टीरिया हमारे पेट में बताते हैं,” एलेक्जेंडर अल्मीडा, EMBL-EBI/सेंगर Postdoctoral साथी फिन टीम है । “हम आशा है कि हमारी सूची में मदद मिलेगी bioinformaticians और सूक्ष्म जीव विज्ञानियों पुल है कि ज्ञान की खाई आने वाले वर्षों में.”

एक स्वतंत्र रूप से सुलभ डेटा संसाधन

सभी एकत्र डेटा में एकीकृत मानव जठरांत्र जीनोम संग्रह और एकीकृत मानव जठरांत्र प्रोटीन सूची में आसानी से उपलब्ध हैं MGnify, एक EMBL-EBI ऑनलाइन संसाधन की अनुमति देता है कि वैज्ञानिकों का विश्लेषण करने के लिए उनके माइक्रोबियल जीनोमिक डेटा और तुलना करने के साथ मौजूदा डेटासेट.

परियोजना पहले से ही उपयोगकर्ताओं के एक नंबर के वैज्ञानिक समुदाय में. के रूप में नए डेटासेट से उभरने अनुसंधान टीमों दुनिया भर में, सूची का विस्तार हो सकता है को शामिल करने के लिए microbiomes के शरीर के अन्य भागों की तरह, त्वचा या मुंह के अंदर.

“इस सूची प्रदान करता है एक बहुत अमीर स्रोत की जानकारी के लिए सूक्ष्म जीव विज्ञानियों और चिकित्सकों. हालांकि, हम की संभावना की खोज करेंगे कई और अधिक उपन्यास बैक्टीरियल प्रजातियों में प्रतिनिधित्व के तहत भौगोलिक क्षेत्र जैसे दक्षिण अमेरिका, एशिया, और अफ्रीका के लिए । हम अभी भी पता नहीं है के बारे में ज्यादा भिन्नता में बैक्टीरियल विविधता भर में विभिन्न मानव आबादी बताते हैं,” अल्मीडा.



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