आरएनए संरचनाओं के हजारों-ScienceDaily


शोधकर्ताओं Bochum और Münster विकसित किया है एक नई विधि निर्धारित करने के लिए संरचनाओं के सभी आरएनए अणुओं में एक बैक्टीरियल सेल में एक बार. अतीत में, यह था के लिए किया जा सकता है व्यक्तिगत रूप से प्रत्येक अणु के लिए. इसके अलावा, उनके सही संरचना, उनकी संरचना के लिए महत्वपूर्ण है समारोह के रनस. टीम का वर्णन करता है नए उच्च throughput संरचना के मानचित्रण विधि, कहा लीड-Seq के लिए नेतृत्व अनुक्रमण, जर्नल में न्यूक्लिक एसिड अनुसंधान, प्रकाशित ऑनलाइन पर 28 मई 2020.

ईसाई Twittenhoff, विवियन ब्रांडेनबर्ग, फ्रांसेस्को Righetti और प्रोफेसर फ्रांज Narberhaus से कुर्सी के सूक्ष्म जीव विज्ञान पर Ruhr-Universität Bochum (रगड़) के साथ सहयोग किया, जैव सूचना विज्ञान समूह की अध्यक्षता प्रोफेसर एक्सल Mosig पर रगड़ और टीम के नेतृत्व में प्रोफेसर पेट्रा Dersch विश्वविद्यालय में Münster, पहले से Helmholtz केन्द्र के लिए संक्रमण में अनुसंधान ब्राउनश्विक.

कोई संरचना — कोई समारोह

सभी जीवित कोशिकाओं में, आनुवंशिक जानकारी संग्रहित है में डबल-असहाय डीएनए और लिखित में एकल असहाय आरएनए, जो तब के रूप में कार्य करता है के लिए एक खाका प्रोटीन. हालांकि, आरएनए नहीं है केवल एक रेखीय नकल की आनुवंशिक जानकारी है, लेकिन अक्सर सिलवटों में जटिल संरचनाओं. के संयोजन एकल-असहाय और आंशिक रूप से तह डबल-असहाय क्षेत्रों के लिए केंद्रीय महत्व के लिए समारोह और स्थिरता के रनस. “अगर हम कुछ सीखना चाहते हैं के बारे में रनस, हम यह भी समझना चाहिए उनकी संरचना कहते हैं,” फ्रांज Narberhaus.

नेतृत्व आयनों प्रकट एकल असहाय आरएनए पदों

नेतृत्व के साथ अनुक्रमण, लेखकों मौजूद है कि एक विधि की सुविधा के साथ-साथ विश्लेषण के सभी आरएनए संरचनाओं में से एक बैक्टीरियल सेल. इस प्रक्रिया में, शोधकर्ताओं का लाभ लेने के तथ्य यह है कि नेतृत्व आयनों के कारण किनारा टूट में एकल असहाय शाही सेना के क्षेत्रों; मुड़ा हुआ आरएनए संरचनाओं, यानी डबल किस्में, द्वारा अछूता रहना नेतृत्व आयनों.

लागू करने के द्वारा सीसा, शोधकर्ताओं विभाजित एकल असहाय आरएनए क्षेत्रों पर यादृच्छिक स्थानों में छोटे टुकड़े, तो लिखित में उन्हें डीएनए और अनुक्रम उन्हें. शुरुआत के प्रत्येक डीएनए अनुक्रम इस प्रकार के लिए corresponded एक पूर्व भूग्रस्त को तोड़ने में आरएनए. “यह हमें बताता है कि इसी आरएनए क्षेत्रों में मौजूद थे के रूप में एक एकल भूग्रस्त बताते हैं,” Narberhaus.

भविष्यवाणी संरचना का उपयोग जैव सूचना विज्ञान

विवियन ब्रांडेनबर्ग और एक्सल Mosig तो इस्तेमाल जैव सूचना विज्ञान का मूल्यांकन करने के लिए पर जानकारी के एकल असहाय आरएनए वर्गों में प्राप्त किया प्रयोगों. “हम मान लिया है कि गैर-कटौती आरएनए क्षेत्रों में मौजूद थे के रूप में डबल किस्में और इस्तेमाल किया भविष्यवाणी कार्यक्रम की गणना करने के लिए कैसे आरएनए अणुओं मुड़ा हुआ होना चाहिए,” बताते हैं विवियन ब्रांडेनबर्ग. “इस के परिणामस्वरूप और अधिक विश्वसनीय संरचनाओं के साथ जानकारी से नेतृत्व अनुक्रमण की तुलना में इस जानकारी के बिना.”

इस दृष्टिकोण सक्षम करने के लिए शोधकर्ताओं के साथ-साथ निर्धारित संरचनाओं के हजारों के रनस के जीवाणु Yersinia pseudotuberculosis एक बार में सभी. टीम की तुलना द्वारा प्राप्त परिणामों का नेतृत्व अनुक्रमण के कुछ आरएनए संरचनाओं के साथ प्राप्त परिणामों पारंपरिक तरीकों का उपयोग कर-वे दोनों थे ही.

नई आरएनए थर्मामीटर की खोज की

समूह के बाहर किए गए उनके प्रयोगों पर 25, और 37 डिग्री सेल्सियस, के बाद से कुछ आरएनए संरचनाओं के परिवर्तन के तापमान पर निर्भर करता है. का उपयोग कर क्या जाना जाता है के रूप में शाही सेना थर्मामीटर, बैक्टीरिया जैसे डायरिया रोगज़नक़ Yersinia pseudotuberculosis पता लगा सकते हैं कि क्या वे कर रहे हैं के मेजबान. का उपयोग कर लीड अनुक्रमण, टीम न केवल पहचान की है पहले से ही जाना जाता आरएनए थर्मामीटर, लेकिन यह भी खोज कई नए लोगों को.

की स्थापना का नेतृत्व अनुक्रमण के बारे में ले लिया है पांच साल. “मैं खुश हूँ कहना है कि हम अब कर रहे हैं करने में सक्षम नक्शा कई आरएनए अणुओं में एक जीवाणु के साथ-साथ,” निष्कर्ष निकाला फ्रांज Narberhaus. “एक विधि का लाभ यह है कि नेतृत्व आयनों को आसानी से प्रवेश रहने वाले बैक्टीरियल कोशिकाओं. इसलिए हम मान लें कि इस पद्धति का इस्तेमाल किया जा सकता है सार्वभौमिक और भविष्य में होगा की सुविधा विस्तृत संरचना समारोह विश्लेषण के जीवाणु रनस.”

कहानी का स्रोत:

सामग्री द्वारा ही प्रदान की जाती Ruhr विश्वविद्यालय Bochum. नोट: सामग्री संपादित किया जा सकता है के लिए शैली और लंबाई ।



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